Son múltiples, y de primer nivel, las referencias matemáticas de la galería y la biblioteca Ambrosiana:
Enorme y bellísimo estudio para la Escuela de Atenas de Rafael.
Códice Atlántico de Leonardo.
Uno de los dos ejemplares de La Divina Proporción de Luca Pacioli, con dibujo de los poliedros originales de Leonardo.
De prospectiva pingendi, autógrafo de Piero della Francesca.
Estatuas de la Artes de la Biblioteca.
Códice miniado de Giovanni d´Andrea con las Artes Liberales.
Destacamos que con las reproducciones de las Artes Liberales del libro de d´Andrea se ha decorado en forma de bajorrelieves la sala Nicolo de Bologna. Debajo de la Aritmética está Pitágoras , y debajo de la Geometría se encuentra Euclides.